حضرت آیت‌الله جوادی آملی یکی از مشکلات حوزه‌‌های علمیه هم ردیف قرار دادن اجماع با کتاب و سنت دانست، گفت: یکی از عیب و نقص اصول این است که در آن عقل جا ندارد و دست ما در آن خالی است، اجماع باید پایین بیاید و عقل بالا برود، منبع باید کتاب، سنت، عقل باشد و اجماع نیز زیر مجموع آن‌ها قرار گیرد، عقل را باید شکوفا کرد.